Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Negr1Q80Z24 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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