Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ttc29Q80VM3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms