Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ifna12Q80SS5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms