Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Dsg1bQ7TSF1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Dsg1bQ7TSF1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Dsg1bQ7TSF1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Dsg1bQ7TSF1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Dsg1bQ7TSF1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Dsg1bQ7TSF1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Dsg1bQ7TSF1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Dsg1bQ7TSF1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Dsg1bQ7TSF1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1bQ7TSF1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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