Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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