Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms