Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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