Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Jmjd1cQ69ZK6 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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