Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Phox2aQ62066 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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