Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad21Q61550 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms