Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cln3Q61124 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cln3Q61124 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cln3Q61124 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cln3Q61124 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cln3Q61124 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cln3Q61124 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cln3Q61124 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Cln3Q61124 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Cln3Q61124 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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