Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3aQ60520 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms