Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl5Q5DTT4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl5Q5DTT4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl5Q5DTT4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl5Q5DTT4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl5Q5DTT4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl5Q5DTT4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl5Q5DTT4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl5Q5DTT4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms