Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms