Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp48Q3V0C5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms