Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc9Q3V038 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc9Q3V038 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc9Q3V038 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc9Q3V038 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc9Q3V038 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc9Q3V038 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ttc9Q3V038 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ttc9Q3V038 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ttc9Q3V038 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9Q3V038 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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