Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnpc3Q3UZ01 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms