Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn4Q3UWL8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn4Q3UWL8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms