Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Acsf3Q3URE1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Acsf3Q3URE1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Acsf3Q3URE1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Acsf3Q3URE1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Acsf3Q3URE1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms