Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxosQ3UL53 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms