Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms