Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

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Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Col24a1Q30D77 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Col24a1Q30D77 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Col24a1Q30D77 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col24a1Q30D77 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms