Protein–RNA interactions for Protein: Q14C37

Lemd1, LEM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd1Q14C37 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lemd1Q14C37 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lemd1Q14C37 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lemd1Q14C37 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lemd1Q14C37 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lemd1Q14C37 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lemd1Q14C37 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lemd1Q14C37 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms