Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms