Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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