Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim24Q0VG18 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim24Q0VG18 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms