Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pate4Q09098 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms