Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sh3bp2Q06649 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms