Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cab39Q06138 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms