Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm11817-201ENSMUST00000155578 685 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox12Q04890 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms