Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cxcr5Q04683 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms