Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec23aQ01405 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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