Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gja5Q01231 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms