Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grin2bQ01097 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms