Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prop1P97458 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prop1P97458 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms