Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp1P97350 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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