Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms