Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nucb2P81117 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nucb2P81117 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nucb2P81117 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nucb2P81117 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nucb2P81117 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nucb2P81117 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nucb2P81117 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms