Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Otx2P80206 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Otx2P80206 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms