Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Usp9xP70398 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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