Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pdlim4P70271 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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