Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkn1P70268 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Pkn1P70268 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkn1P70268 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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