Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SbdsP70122 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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