Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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