Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn18P56857 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn18P56857 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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