Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rad23bP54728 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms