Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms