Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
VdrP48281 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
VdrP48281 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VdrP48281 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VdrP48281 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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