Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc10P31257 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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