Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms